食管癌和胃癌都是上消化道的恶性肿瘤，同时它们也是好发于中国的常见肿瘤。这两种癌症的确诊主要靠胃镜活检的病理诊断。而临床分期主要依据影像学检查（如超声胃镜、胸腹部CT或磁共振等）。通过病理诊断及临床分期，我们就可以制定患者的综合治疗方案。临床分期目前国际上多采用美国AJCC/国际UICC分期标准(TNM分期系统)，食管癌和胃癌均分为四期，分期的依据是肿瘤的侵润程度(T)，有没有淋巴结转移(N)或者远处转移(M)。TNM三方面一组合能确定了患者的具体分期了（分为I～IV期不等）。临床实际工作中，手术前的或无法做手术的分期又称为临床分期（cTNM）。无论是食管癌还是胃癌，临床分期为I、II期的可考虑直接做根治性手术治疗，而III、IV期的中晚期患者就要根据具体情况来做不同治疗方案的选择。
就III期患者来说，目前推荐先做新辅助治疗（用于术前的辅助治疗），在临床上，既可以选择单用新辅助化疗，也可以选择新辅助放化疗的综合治疗（包括同步放化疗或序贯放化疗），通过这样的新辅助治疗，既可以使局部肿瘤得到较好的控制（缩小），又可以消灭可能存在的远处转移（尤其是目前医疗设备还无法查见的亚临床病灶），关键是通过这样的新辅助治疗能使一部分患者得到一个明显的降期（如从III期降为II期，甚至降为I期），为手术根治及肿瘤的治愈提供了更多的可能。当然，对于III期患者来说，考虑直接做根治性手术治疗也是一种选择，但相对于新辅助治疗后再做根治性手术，患者可能会有更高手术切除率和更好的预后。
另外，对于一部分通过新辅助治疗不能转化为手术的局部晚期的III期患者来说，可以通过放化疗综合治疗来根治（尤其是食管癌）或显著延长患者的生存时间。当然，对于一般情况较好的患者，同步放化疗是首选，目前有限的临床数据表明，同步放化疗可能要优于序贯放化疗，但同时副作用也有所增加。
对于不能手术的IV期（晚期）患者来说，全身药物治疗成为了他们改善生活质量和延长生存时间的不二选项。针对晚期食管癌和胃癌的药物治疗主要有化疗和靶向治疗。针对胃癌和食管腺癌，如果免疫组化提示Her-2+++或FISH法+，可考虑在全身化疗的基础上加用靶向药物赫赛汀治疗，这样的化疗加靶向治疗组合可使患者的有效率和生存率能得到一个显著的提高。对于一线治疗失败后的患者，可考虑换用二线化疗方案并加用抗血管生成治疗（雷莫芦单抗），而三线治疗目前推荐靶向药物阿帕替尼治疗（口服抗血管生成药物）。对于晚期食管鳞癌，无论是一线还是二线，目前还是推荐以全身化疗为主，三线以后可以试用阿帕替尼治疗（近期疗效较好）。当然，对于一般情况较差的晚期患者，姑息及营养支持治疗要贯穿始终，以最大限度减少他们的痛苦并适当其延长生存时间。
