以齿状线为界，齿状线以上的直肠是由自主神经的交感神经和付交感神经支配，故齿状线以上的直肠粘膜无疼痛感。肛门内括约肌收缩由自主神经支配。
齿状线以下的肛管及其周围结构主要由阴部神经的分支支配，阴部神经由2，3，4骶神经发出。肛门外括约肌的运动及齿状线下方的感觉受会阴神经支配，非常敏感。
阴部神经主要的分支有肛直肠下神经，前括约肌神经，会阴神经和肛尾神经。
需要注意的是第4骶神经的会阴支穿过肛提肌与尾骨肌之间的裂隙，或穿过尾骨肌至坐骨直肠窝的后部，支配肛门外括约肌后部，其皮支分部于肛门及尾骨之间的区域。也就是说神经分布到了肛门后部和肛门周围。
故肛周手术如行肛周浸润麻醉时，应特别注意在肛管两侧及后方要浸润完全，临床工作中，我常常在后部，肛门与尾骨之间的中点，约长强穴处首先封闭一针，肛周两侧各两个点进行浸润麻醉。肛门前部不做深部麻醉，避免损伤泌尿系。
