灵芝孢子粉对多种理化及生物因素引起的肝损伤有保护作用。无论在肝脏损害发生前还是发生后，服用灵芝软胶囊都可保护肝脏，减轻肝损伤。灵芝软胶囊能促进肝脏对药物、有害物质的代谢，对于中毒性肝炎有确切的疗效。尤其是对慢性肝炎，灵芝孢子粉可明显消除头晕、乏力、恶心、肝脏不适等症状，并可有效地改善功能，使各项指标趋于正常。
临床上，灵芝孢子粉一向被认为是治疗肝炎的良药，研究报告指出，最好在肝功能还没有严重损害之前用灵芝孢子粉，治疗2-5周，效果非常显著。
灵芝孢子粉治疗各种病毒性肝炎的总有效率为73%-97%，显效率为44%-77%，病人的乏力，食欲不振，腹胀及肝脏疼痛等症状减轻或消失，谷丙转氨酶恢复正常或有不同程度降低，肿大的肝脾也恢复正常或缩小。有学者称，灵芝孢子粉治疗HBsAg阳性慢性活动性肝炎，总有效率为90%。一般来说，灵芝对急性肝炎的疗效较慢性或迁延性肝炎为好。临床报导用灵芝治疗急、慢性肝炎50例，每日服用3次，连续服用60天。结果：痊愈6例，显效12例，总有效率为98%。
有报道采用灵芝孢子粉治疗黄疽性肝炎11例。每日服用3次，每次4粒，连服13个月。结果：临床治愈22例，显效8例，有效9例。总有效率达97%。
李强等观察110例慢性硬化乙肝炎治疗结果表明，灵芝孢子粉复配小牛胸腺肽，使HBeAg阴转率可达到73.3%，抗HBe阳转率达59.8%，抗HBc阴转率为12.9%，无1例产生抗HBs，HBsAg阴转率为6.8%，优于单用西药对照组，显示中西结合比单用西药治疗乙型肝炎有较好疗效。
慢性肝炎迁延不愈，日久可发展成严重的肝硬化，灵芝孢子粉对肝硬化也有一定的疗效。刘润森等报道，以灵芝孢子粉治疗150例各类肝硬化患者，1个疗程以上，并进行自身前后对照。结果显示：主要症状多在1个月内明显改善，1个疗程总有效率在90%以上；对常见体征如腹水、脾大的总有效率在70%以上：对肝功能及病毒复制指标的总有效率亦在50%以上。在临床上，治疗专用的为医用级灵芝孢子粉，功效成分10：1以上浓缩的灵芝制剂。
