我的眼肿了很疼总觉得里面有杂物是不是可能和擦眼泪的纸巾有关的吗？

你的情况考虑主要是有结膜炎导致的可能性较大，可以到眼科检查确定，然后可以采用氯霉素眼药水进行治疗，注意用眼卫生的