早前人类的食物基本上都是天然食物，哪怕是三十年前，水是河流水、地是黄土地，尽管吃的不好，但也不至于出现众多的肠胃疾病。现在生活条件好了，身边多了许多有肠胃炎的朋友。进而出现各种养肠胃的饮料、饼干、益生菌等等。
人类已经是地球上食物链最顶端的生物了，其实居住环境及饮食习惯等多种因素都会有不利于人体内的益生菌生长繁殖，对人体益生菌群的不利因素越来越多，越来越多的人们需要不断补充益生菌，才能满足健康需要。
现代人在饮食中摄入的益生菌的数量越来越少
现代的许多食品为保证“不坏”，不腐，进入尽可能多的抗生素，微生物统统杀死。添加防腐剂、增稠剂、香精、香料等人工合成的添加剂不利于体内益生菌群的生存与增殖。
越来越多的人选择剖腹产和配方奶粉代替母乳
大龄生育、剖腹产率高、母乳喂养不足、人工喂养等使孩子先天益生菌获得不足或被破坏。母乳中含有活性益生菌，而大部分配方奶粉十分“干净”，不含这些特殊成分。国外研究者从母乳中分离出源自益生菌的类抗生素（细菌素），此物质能预防婴儿胃肠道感染。
环境污染、生态恶化、空气及水质量下降
人人都不会喝河流水，不仅如此，人们也不喜欢自来水。赖以生存的空气和水质量不断下降，空气净化器和饮用水净化器卖的特别好。城市饮用水往往必须经过自来水工厂的净化技术处理，尤其是经过氯处理后，含氯的饮用水会损害人体内的益生菌生长繁殖。
现代人生活工作紧张、压力大
益生菌对人体的压力状况极为敏感。因为压力增大会改变人体内的荷尔蒙平衡，导致人体内的益生菌群数量减少。
如波尼松（一种肾上腺皮质激素），这些都会减低人体内益生菌群的数量和影响正常的人体机能。
现代人的饮食结构不够合理
有的喜欢过分熟食，有的喜欢过分生食。饮食中大量的精细碳水化合物和糖类会促进有害菌和酵母的生长且抑制有益细菌的繁殖。膳食中过多的肉类和过少的蔬菜水果会削弱益生菌的活性。
频繁使用抗酸和其它酸性减少药物
现代人对药品的消费确实多了，药物的种类和数量逐年上升。
口服避孕药
以口服避孕药形式被人体摄入的合成雌激素或某些荷尔蒙替代物，会明显减少体内有益微生物菌群的数量。
各地出差、旅行变得更加频繁
国人讲究故土难离，经常会出现水土不服的现象。工薪族到全国各地或世界各地出差、旅行变得更加频繁。而各地的环境和饮食中微生物菌群的种类和数量都有所不同，（指正常菌群与宿主之间的相对平衡遭到破坏，正常菌群紊乱、失调的一系列症状）和益生菌群减少的情况，这使他们表现为腹泻和水土不服等症状。
