药流后第三天，孕囊已经排出，小腹有点不舒

考虑是子宫收缩导致的腹痛，可以服用益母草膏和阿莫西林消炎促进子宫收缩观察，需要注意多休息，做好复查的。

药流以后一周内小肚子不舒服，这个属于是子宫的收缩疼痛，一般需要常规性的抗生素消炎治疗，同时配合活血化瘀治疗，7到10天需要复查彩超，观察子宫恢复的情况。